В Учебном корпусе предусмотрено устройство подземных и цокольного этажей высотой не менее 4,0 м в чистоте для размещения лаборатории инновационных технологий в челюстно-лицевой хирургии, научно- практического отделения лучевой диагностики, инженерных сетей и оборудования.
Второй — четвертый этажи отведены для размещения административных помещений и размещения Управления научно-образовательной деятельностью ФГБУ НМИЦ «ЦНИИСиЧЛХ» Минздрава России.
На пятом этаже размещается центральное стерилизационное отделение и технические помещения инженерных служб.
На шестом — одиннадцатом этажах размещаются научно-практические отделения:
- Патологии пародонта и регенеративной медицины;
- Малоинвазивная хирургия полости рта;
- Персонифицированная профилактика заболеваний твердых тканей зубов;
- Кариесология, эндодонтия и реставрация зубов;
- Лечение под микроскопом;
- Инновационная ортодонтия для детей и взрослых;
- Ортопедическая стоматология ранних нагрузок на импланты в челюстно-лицевой области;
- Инновационная имплантология;
- Междисциплинарное сложное протезирование и гнатология;
- Ортопедическая стоматология.
На двенадцатом этаже размещается конгресс холл.
Тринадцатый этаж технический.
Для вертикальной связи верхних этажей предусмотрены две лестничные клетки, имеющие выход непосредственно наружу, три пассажирских лифта.
Один грузовой лифт для загрузки подземных этажей.